一、采購項目名稱及內容

采購人：廣西壯族自治區疾病預防控制中心；

采購項目名稱：免疫規劃檢測項目測序服務；

項目編號：2024-FW-003；

資金來源：財政資金。

二、項目內容

（一）菌株全基因組測序：30次。

1．樣本類型和數量：純化后的細菌6株

2．DNA提?。翰捎?/span>SDS或STE的方法對樣本的基因組DNA 進行提取，之后利用瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA 的純度和完整性，利用Qubit進行定量。

3．文庫構建： 經電泳檢測合格的 DNA 樣品用 Covaris 超聲波破碎儀隨機打斷成長度約為350bp的片段。處理完成后的DNA片段，使用 NEBNext?Ultra? DNA Library Prep Kitfor Illumina(NEB, USA)試劑盒，經末端修復、加A尾、加測序接頭、純化、PCR擴增等步驟完成整個文庫制備。

4．文庫檢測：文庫構建完成后，先使用 Qubit 2.0 進行初步定量，稀釋文庫至 2ng/ul，使用 Agilent對文庫的插入片段進行檢測，insert size符合預期后，使用 Q-PCR 方法對文庫的有效濃度進行準確定量，以保證文庫質量。

5．測序和交付平臺：使用illumina NovaSeqPE150上機測序，運行智能化交付系統和自動化樣本庫系統；

6．數據質量：原始下機數據測序質量要求: Q20≥90%，Q30≥85%；

7．數據量：raw data≥1G/樣本；

8．數據交付：需要交付clean data；

9．周期要求：需要保證項目可加急得到響應，二代測序儀充足≥15臺；

10．生物信息學分析內容：

①　原始下機數據處理:過濾測序質量值低的reads，保留高質量reads，得到Clean Data；

②　樣品組裝: 進行基因組組裝，得到能反映樣品基因組基本情況的序列文件，并對組裝結果進行評價；

③　基因組組分分析 組裝完成后，分析樣品基因組的成分，包括編碼基因、非編碼RNA、重復序列、前噬菌體、基因島、CRISPR等基因組成分的預測；

④　功能注釋 針對編碼基因序列進行不同數據庫的功能注釋，包括常用的KEGG、COG數據庫、針對病原微生物的數據庫；

⑤　基因組比較分析 此步驟從基因組、基因兩層面分別比較樣品與參考基因組的差異，包括共線性分析、基因家族構建、共有/特有基因分析、物種進化樹構建。

（二）一代測定服務：400反應。

1．樣本為PCR產物和引物，PCR產物未純化，引物濃度為20μM。

2．★一代測定服務包括：序列測定在技術服務公司實驗室完成，對PCR產物純化，并按照送樣者要求的長度進行基因序列測定。將測序結果以圖譜形式反饋。

3．★ PCR產物純化方式：膠回收純化。

4．測序要求：雙向或者單向，送檢單會標明。

5．測序序列質量：一個正常的成功反應，能保證測序色譜圖文件（*.abi） 峰形清晰，無雜峰，峰值明顯。

6．★提供的結果為：測序色譜圖文件（*.abi）、終序列、拼接序列（*.fas或*.fasta）。結果反饋地點及數量：按照采購方要求發往指定服務地點。

7．檢測中使用的試劑和耗材均需為優質無菌。

8．開展服務的實驗室符合二級生物安全實驗室要求，具備生物安全柜。

9．凡該樣本在檢測過程中發生的污染和各類糾紛，后果由服務商承擔。

10．★服務商負責樣品運輸，樣本運輸必須在帶冰條件下運輸。運輸過程中造成的損失、污染、及各類糾紛，后果均由服務商承擔。運輸費用由服務商承擔。

11．樣本交接：根據采購方的要求，在廣西壯族自治區疾病預防控制中心不定期進行標本交接。

12．服務商及技術服務公司未經采購方同意，不能將剩余樣本另作他用或轉讓給第三方使用，根據采購方要求進行保存返回或按照相關規定處理。

（三）提供的成果

包含但不限于：出具檢測原始數據、匯總結果（Excel文件列出標本名稱以及對應的各指標結果）、樣本接收單。

（四）提交服務成果時間

收到樣本并質檢合格后，一代測定服務于3～8個工作日內完成檢測并返回結果；菌株全基因組測序于30個工作日內完成所有項目分析內容。售后服務包括能提供現場報告解讀。若樣本未檢出或峰圖有雜峰等無法分析，重測也如此，視為此次測序無效，采購方將不支付相應費用。如連續三次未及時反饋結果，采購方有權拒絕支付相應費用，并追究樣本損失。

（五）其他要求：

1．開展服務的實驗室符合二級生物安全實驗室要求，具備生物安全柜。

2．凡該樣本在檢測過程中發生的污染和各類糾紛，后果由服務商承擔。

3．★ 服務商負責樣品運輸，樣本運輸必須在帶冰條件下運輸。運輸過程中造成的損失、污染、及各類糾紛，后果均由服務商承擔。運輸費用由服務商承擔。

4．樣本交接：根據采購方的要求，在廣西壯族自治區疾病預防控制中心不定期進行標本交接。

5．服務商及技術服務公司未經采購方同意，不能將剩余樣本另作他用或轉讓給第三方使用，根據采購方要求進行保存返回或按照相關規定處理。

①　PCR產物測序使用的試劑應具備中華人民共和國醫療器械注冊證（體外診斷試劑）或者為成熟的商業化試劑盒，使用的測序儀應具備中華人民共和國醫療器械注冊證或者為成熟的商業化測序平臺。

②　實驗過程必須嚴格按照試劑說明書進行操作；在PCR產物質量過關的前提下，中標供應商須對每批樣本測序實驗進行質控，不可出現實驗交叉污染、樣本弄混等嚴重錯誤；出現此類錯誤導致的一切成本損耗皆由其負責。

③　參與投標的供應商須具備純化PCR產物的能力，并保證PCR產物符合測序要求；接收到待檢樣本后至建庫測序數據產出，應有嚴格的質控標準；具有短期處理大量樣本，進行一代測序的經驗；不得將測序服務轉包第三方公司。

④　樣本收取及運輸管理：按照《可感染人類的高致病性病原微生物菌（毒）種或樣本運輸管理規定》的運輸管理規范進行標本運輸，根據采購人指定的時間、地點，由中標供應商上門收樣后將樣本運回實驗室。

⑤　采購人對檢測調查結果擁有所有權，供應商對檢測調查結果負有保密義務，僅提供給采購人或采購人指定的人員；未經采購人許可，不得對第三方泄露檢測信息，不得在報刊雜志上發表或作其他任何用途的引用。

⑥　中標供應商應在樣本接收后及時對PCR產物進行質檢，將結果反饋給采購人；所有未使用完的樣本應免費保存至少1個月，并在必要時返回原樣。剩余樣本未經采購人同意不能將另作他用、轉讓給第三方使用或應按照相關規定高壓后處理。

（六）服務地點：檢測服務在中標供應商的實驗室內完成。

（七）采購預算：3.14萬元，其中菌株全基因組測序為700元/株、一代測定為26元/反應。

（八）報價要求：包括：服務的價格；必要的保險費用和各項稅金；運輸、裝卸、安裝、調試、培訓、技術支持、售后服務、稅金及其它所有成本費用的總和。

采購項目的名稱、數量、簡要規格描述詳見附件報價表，須用使用統一格式報價表，否則投標無效。

（九）付款條件：按中標實際單價、實際檢測并驗收合格的份數進行結算。

（十）采購結果認定：滿足采購需求的前提下最低價中標，超出預算的投標視為無效。

二、資格要求及條件

1.投標人須是國內注冊企事業單位，擁有獨立法人資格，具有有效的營業執照、稅務登記證、組織機構代碼、技術服務許可證。

2.檢測實驗室必須已開展測序服務實驗（提供復印件，原件備查）并承諾獨立完成本項目，不得轉讓或轉包或分包。

3.投標人須符合《政府采購法》第二十二條規定的條件；

4.投標人在“信用中國”網站（www.creditchina.gov.cn）或中國政府采購網（www.ccgp.gov.cn）查詢相關供應商主體信用記錄，將查詢結果加蓋投標人單位公章提交（必須提供，如為事業單位及高?？刹惶峁?；

5.服務工作周期：簽訂合同之日起到2025年5月31日。如連續三次未及時反饋結果，采購方有權拒絕支付相應費用。

6.具有履行合同所必需的人員和專業服務能力；

7.國家法律、法規規定的其他要求；

8.驗收方式：

供應商提供的成果包含提供的成果包含出具檢測原始數據、匯總結果（Excel文件列出標本名稱以及對應的各指標結果）、樣本接收單等進行驗收。

9.付款方式

按實際檢測份數及項目報價單價結算，采購人收到并對結果無異議，憑驗收單中的檢測實際數量，根據供應商開具相應發票，在10個工作日內支付全部的費用。采購人對發票有異議的，應在收到發票后3日內向供應商提出異議，雙方協商解決。

10.其他：應統一按附件報價表進行報價，不能惡意低價投標。

11.投標人根據報價表填寫擬采購項目相關信息及價格一同密封提交（資格要求及條件材料裝訂成冊）。閉封袋密封處需加蓋遞交單位公章，密封文件袋封面須注明產品名稱，遞交公司全稱（信封密封口蓋騎縫章）。

三、投送材料截止時間、地點

1.截止日期：2024年5月31日下午16點；

2.截止地點：南寧市青秀區金洲路18號廣西疾病預防控制中心行政樓2樓206號房。采購管理科聯系人及電話：蒙婧婷、李杰文0771-2521500。

        fw-003統一報價表.xlsx

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　廣西壯族自治區疾病預防控制中心 

       　　　  　   　　　　　　　　　　　　　　　　　　　        2024年5月23日